有法院调查令不配合怎么办

如果法院向有关单位或部门调查取证，对方不配合的话人民法院除责令其履行协助义务外，并可以予以罚款、拘留；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
【法律依据】
《民事诉讼法》第六十七条，人民法院有权向有关单位和个人调查取证，有关单位和个人不得拒绝。人民法院对有关单位和个人提出的证明文书，应当辨别真伪，审查确定其效力。