建设工程约定管辖法院有法律效力吗

有效。
建设工程合同纠纷一般由合同约定的履行法院管辖，但合同没有约定时，由发包人接受图纸所在地人民法院管辖。按规定，两个以上人民法院都有管辖权的诉讼，原告可以向其中一个人民法院起诉;原告向两个以上有管辖权的人民法院起诉的，由最先立案的人民法院管辖。
法律依据：
《民事诉讼法》第二十三条
因合同纠纷提起的诉讼，由被告所在地或合同履行地人民法院管辖。