财政局会查出经济犯罪吗

不会，这不属于财政局的工作范围。
查出经济犯罪是检察院还有经侦局的工作。属于检察院管辖的职务经济犯罪由检察院反贪污贿赂局立案侦查。如果涉嫌职务犯罪的由检察院反渎职侵权局立案侦查。如果是普通的经济犯罪由公安局的经济犯罪侦查部门立案侦查。