被执行人否认抵押事实存在的，应该怎么样确定被告？

根据《民诉解释》的规定，申请执行人提起执行异议之诉的，以案外人为被告。被执行人反对申请执行人主张的，以案外人和被执行人为共同被告。据此可知，丙银行应当以甲、乙两公司为共同被告来起诉。