商标注册人撤诉后应该如何处理

对于撤诉问题，无论是商标民事诉讼，还是商标行政诉讼，都有近似的规定。
对于原告的撤诉，法院应当以裁定的方式确认是否准予撤诉。如果准予撤诉，则案件审理终止。如果法院不同意撤诉，则案件应当继续审理。如果法院不同意撤诉，原告又拒绝出庭，法院可以缺席审理并判决。
法律依据：
《中华人民共和国民事诉讼法》第一百四十五条
宣判前，原告申请撤诉的，是否准许，由人民法院裁定。人民法院裁定不准许撤诉的，原告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，可以缺席判决。