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1、假如你在试验中获得了一个新蛋白质序列,如何测定其结构?(急求?

2015-06-20 04:12:24y***
1、假如你在试验中获得了一个新蛋白质序列,如何测定其结构?(急求答案 好心人帮帮忙吧 谢谢)1、假如你在试验中获得了一个新蛋白质序列,如何测定其结构?(急求答案好心人帮帮忙吧谢谢):蛋白质结构预测主要有两大类方法。一类是理论分析方法或从头算方法(Ab ?

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  •   蛋白质结构预测主要有两大类方法。一类是理论分析方法或从头算方法(Ab initio),通过理论计算(如分子力学、分子动力学计算)进行结构预测。该类方法假设折叠后的蛋白质取能量最低的构象。从原则上来说,我们可以根据物理、化学原理,通过计算来进行结构预测。
      但是在实际中,这种方法往往不合适。主要有几个原因,一是自然的蛋白质结构和未折叠的蛋白质结构,两者之间的能量差非常小(1kcal/mol 数量级),二是蛋白质可能的构象空间庞大,针对蛋白质折叠的计算量非常大。另外,计算模型中力场参数的不准确性也是一个问题。
       另一类蛋白质结构预测的方法是统计方法,该类方法对已知结构的蛋白质进行统计分析,建立序列到结构的映射模型,进而根据映射模型对未知结构的蛋白质直接从氨基酸序列预测结构。映射模型可以是定性的,也可以是定量的。这是进行蛋白质结构预测较为成功的一类方法。
      这一类方法包括经验性方法、结构规律提取方法、同源模型化方法等。
    2015-06-20 11:18:03
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