签的书面协议对方不承认怎么办

1、如果对方不承认，可以向人民法院提起诉讼，维护其自身合法权益。
2、根据"谁主张谁举证"原则，原告向法院起诉时应当提交能够证明其诉讼请求的证据，虽无书面形式的合同，但也可凭借其他辅助证据证明案件的事实。比如：微信聊天记录、通话录音、视频录像、收发货交接单、往来函件邮箱、证人等。凡是能够证明合同当事人各方权利义务的，都可以视为证据提交给法院。